La Auditoría Tributaria a diferencia de un diagnóstico, permite mediante pruebas sustantivas, verificar la exactitud del cumplimiento material de cada uno de los impuestos nacionales, las tasas e impuestos municipales, las cuotas de seguridad y el cumplimiento con otras entidades reguladoras y fiscalizadoras como el Ministerio de Salud, Ministerio de Gobierno y Justicia, Ente Regulador y otros, según sea el caso.

Se determinan los montos de las deficiencias y se cuantifican las consecuencias de las desviaciones de la ley.

En tal sentido, se examina si el cumplimiento o desviación de la ley pudiera causar una contingencia monetaria y cuál sería el impacto económico en la empresa.